水样浑浊也会影响分析结果。用适当孔径的滤器可以有效地除去藻类和细菌，滤后的样品稳定性更好。一般地说，可用澄清、离心、过滤等措施来分离悬浮物。国内外已采用以水样是否能通过孔径为0.45微米滤膜作为区分可过滤态与不可滤悬浮态的条件，能够通过0.45微米微孔滤膜的部分称为“可过滤态”部分，通不过的称为“不可过滤态”部分。采用澄清后取上清液及用中速定量滤纸、砂芯漏斗、离心等方式处理样品，相互间可比性不大，它们阻留悬浮物颗粒的能力大体为滤膜＞离心＞滤纸＞砂芯漏斗。要测定可过滤态部分，就应在采样后立即用0.45微米的微孔滤膜过滤。在暂时没有0.45微孔滤膜的情况下，泥沙型水样可用离心等方法；含有机质多的水样可用滤纸（或砂芯漏斗）；采用自然沉降取上清液测定可过滤态则是不恰当的。如果要测定组分的全量，采样后立即加入保护剂，分析测定时应该充分摇匀后取样。
